1903年，岳麓书院改湖南高等学堂后，正式迈开了近代化教育的步伐。

1912年9月，湖南省优级师范学堂改名湖南高等师范学校，迁入岳麓书院办学，以培养中等学校的各科教员为主要任务。凤高翥、符定一、吴嘉端、刘宗向等先后担任校长，杨昌济、符定一、朱剑凡、徐特立、施文尧、吴家镇等担任教育学科的教员。

1926年，省立湖南大学定名。1928年，湖南大学设文理工三科，文科设有政治系、经济系，拟增设史地系，开办心理实验所，购买心理学的仪器和设备，聘请心理学教师，为增设教育系做预备。

1929年，湖南大学在文学院中设教育系，主要目的是为湖南省培养中等学校的师资，首届招生10人。这标志着教育学科在湖南大学的正式起航。1930年，湖南大学共设有文学院、理学院和工学院，文学院下辖中国文学系、教育学系、政治经济系和商学系。1931年12月，湖南大学教育学会举办的《教育丛刊》创刊号印发，黄士衡（1935年任湖南大学校长）题写刊名。

1929年至1941年，湖南大学教育学科吸引了众多海内外优秀学者，如梁培德、熊铭青、杜元载、黄子通、钱慰宗、罗敦厚、刘行骏、刘亦常、吴绍熙和黄如今等。著名心理学家、毕业于中央大学心理学系的梁培德教授，1930年入职湖南大学教育学系，1931年任教育系主任，主讲教育心理、心理测验、实验心理、教育统计等课程。1933年，梁培德教授以湖南大学为第一单位发表一篇英文论文，这是湖南大学最早被SCI-E和SSCI收录的论文。杜元载教授获美国西北大学法学博士学位，1932年执教湖南大学教育学系，主讲西洋教育史、中国教育史、教育行政、比较教育学等课程，1958年出任台湾师范大学校长。黄子通教授获加拿大多伦多大学哲学博士学位，1936年入职教育学系，先后担任教育学系教授、主任、文学院院长等职，带领哲学教育学系和中文系教师在辰溪校区共同成立了“文哲丛刊社”，创立了《文哲丛刊》。熊铭青、黄如今、钱慰宗等教授硕士毕业于哥伦比亚大学。

1937年前，湖南大学教育学系的心理学专业在全国都有很大影响。当时讲授心理学的除梁培德教授外，还有博士毕业于芝加哥大学的倪中方教授、哥伦比亚大学的张君俊等。心理学专业开设课程非常齐全，如普通心理学、教育心理学、心理实验、社会心理学、应用心理学、心理卫生、心理测验、学习心理、学科心理、发展心理学、儿童心理学、青年心理学等。学校设有一间能同时容纳24名学生进行实验的心理学实验室，多数实验仪器购自美国、德国。

1937年，湖南大学由省立改为国立。1938年，教育学系停止招收大一新生。1939 年，湖南大学迁入辰溪校区，教育学系改名为哲学教育学系，使之与蓝田的国立师范学院教育学系区别开来，师生大体上未发生变化。从 1937年到1941 年，湖南大学教育学科在逆境中坚持培养人才，不畏社会环境恶劣和抗战局势紧张，培养了52 名毕业生，占全校毕业生总数和省立时期基本持平。1929年至1941年，湖南大学的教育学科共计培养毕业生92人，占全校总数8.4%。

1949年，国立师范学院并入湖南大学，组建成立教育学院，下设教育系、体育系和体育专修科，首任院长杨国荣。学院建有先进的教育心理实验室和心理测验室，共有实验仪器150件，由杨国荣、陈孝禅教授创建的湖南大学高级神经活动实验室当时在国内同行中影响很大。1953年院系调整，教育学科调离湖南大学。

1981年3月24日，湖南大学成立高等教育研究室，成文山教授兼任主任，杨联京、涂序华任副主任，重点开展“朱熹教育思想和湖南大学校史”“近代高等教育理论”“高等学校科学管理”“大学生政治思想工作规律”等研究。1983年，机械工业高等教育研究会创办《机械工业高教研究》（后更名为《大学教育科学》），由湖南大学主办。1984年，湖南大学高等教育学会成立。1986年，湖南大学高等教育学会创办会刊《高等教育研究》，翁祖泽教授任主编。同年11月，由华中工学院、湖南大学、南京航空航天学院共同发起的首届“大学教育思想研讨会”在长沙举办。1987年2月，高等教育研究室更名为高等教育研究所，下设高教研究室、资料情报室、编辑室。1989年12月，学校调整高等教育研究所领导班子，翁祖泽教授兼任所长，孙宗禹同志任常务副所长。

1998年设立“高等教育学”硕士学位授予点，是湖南省最早设立的高等教育学硕士学位授权点之一。

自2006年正式成立教育科学研究院以来，相继获得“教育硕士”专业学位授权点、“教育管理学”二级学科博士授权点。近年，依托管理科学与工程一级学科的“教育决策与管理”方向正式招收博士生。